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　　MicroRNAs (miRNAs)作為轉(zhuǎn)錄后基因表達(dá)的一個(gè)重要的調(diào)控因子，參與了包括發(fā)育、代謝、疾病的發(fā)生等各種重要的生理過程。家蠶基因組的測(cè)序完成為在全基因組水平鑒定家蠶miRNAs以及與其他昆蟲進(jìn)行比較基因組學(xué)研究提供了契機(jī)。

　　在中國(guó)科學(xué)院北京基因組研究所于軍研究員的指導(dǎo)下，俞曉敏、周青、蔡亦梅所在小組建立了一套基于Srnaloop及已知?jiǎng)游飌re—miRNAs結(jié)構(gòu)特征的miRNA的預(yù)測(cè)體系；同時(shí)，利用miRNAs克隆鑒定平臺(tái)，對(duì)家蠶14個(gè)發(fā)育時(shí)期的miRNAs進(jìn)行克隆鑒定。利用計(jì)算預(yù)測(cè)結(jié)合克隆測(cè)序的方法，一共鑒定了118個(gè)保守的家蠶miRNAs和151個(gè)新的miRNAs。對(duì)118個(gè)保守的miRNAs分析后發(fā)現(xiàn)，有6對(duì)進(jìn)化上保守的miRNAs簇；同時(shí)發(fā)現(xiàn)，Dicer的不精確和選擇性剪切可能賦予miRNAs新的功能。對(duì)克隆到的miRNAs在14個(gè)家蠶發(fā)育時(shí)期分布進(jìn)行分析，發(fā)現(xiàn)家蠶四齡蛻皮期miRNA的表達(dá)種類和數(shù)量上均多于其他發(fā)育時(shí)期，進(jìn)一步利用Stem—loop RT PCR分析表明，部分保守的miRNAs在該時(shí)期表達(dá)量變化比較劇烈，提示miRNAs在家蠶蛻皮期可能起著至關(guān)重要的調(diào)控作用。在對(duì)15個(gè)保守的家蠶miRNAs進(jìn)行表達(dá)量分析后，發(fā)現(xiàn)其中的8個(gè)miRNAs表達(dá)量在不同的發(fā)育時(shí)期變化明顯，結(jié)合靶基因預(yù)測(cè)的結(jié)果以及家蠶發(fā)育階段的特點(diǎn)，篩選并分析了部分miRNAs的靶基因及其在家蠶發(fā)育過程中可能的作用機(jī)制，為系統(tǒng)的發(fā)掘和闡明miRNAs在家蠶發(fā)育過程中的調(diào)控機(jī)制研究提供理論依據(jù)。

　　目前，該小組正在結(jié)合家蠶新公布的精細(xì)基因組數(shù)據(jù)，對(duì)家蠶miRNAs進(jìn)行深度挖掘；同時(shí)，基于前期的研究結(jié)果，開展miRNAs在家蠶蛻皮期調(diào)控機(jī)制的研究。該課題將作為我所正在進(jìn)行的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的一個(gè)重要組成部分，并為轉(zhuǎn)錄組學(xué)后續(xù)的功能學(xué)研究建立良好的技術(shù)平臺(tái)。